Le monde est secoué par la nouvelle d'un homme ayant tué un éléphant monstrueux à mains nues. De retour au Japon, Baki est assailli par un enfant armé d'un couteau.
Afin de se préparer à son inévitable combat contre son père, Baki s'entraîne contre une mante religieuse géante imaginaire, fruit de son esprit.
Lors d'un défilé sous haute surveillance, le président des États-Unis est enlevé au vu et au su de tous par un jeune homme inconnu.
Baki fait la connaissance d'un homme que l'on appelle de "M. Numéro deux", un détenu puissant qui semble bénéficier de privilèges spéciaux au sein de la prison.
À quelques semaines de sa libération, Iron Mike est attaqué par trois voyous engagés pour s'assurer que l'ex-champion de boxe ne combatte plus jamais.
Alors que les triplés Mouth s'apprêtent à infliger le coup de grâce à Iron Mike, Guevaru intervient et déclenche un combat.
Guevaru refuse de croire que Biscuit Oliva, le détenu le plus célèbre de la prison, purge confortablement sa peine avec sa petite amie.
Le duel entre Guevaru et Oliva commence, et les règles sont simples : le premier qui lâche le morceau de tissu qu'ils tiennent perd.
Guevaru lutte pour son peuple et refuse de s'avouer vaincu. Plus tard, Oliva fait une découverte.
Baki est encerclé par des gardes qui pointent leurs armes sur lui. Mais loin d'être inquiet, il semble avoir une idée derrière la tête.
Lorsqu'il entre dans la cellule d'isolement de Baki pour lui proposer un combat deux semaines plus tard, Oliva déclenche par inadvertance un incident majeur.
Baki apprend à ses dépens qu'il n'est peut-être pas prêt à affronter l'homme appelé "M. Unchained", la puissance et la technique d'Oliva étant d'un tout autre niveau.
Le capitaine Strydum annonce à Baki une nouvelle fracassante : la découverte par des scientifiques d'un être humain conservé dans une plaque de sel datant du Jurassique !
Peu après l'arrivée de l'homme préhistorique à Tokyo, les plus féroces combattants clandestins du pays cherchent à l'affronter.
Habitué à dévorer des dinosaures, Pickle peine à trouver quelque chose de mangeable dans le Japon d'aujourd'hui. Dans l'espoir de le combattre, Retsu s'offre comme proie.
Après que Retsu lui a fait goûter à des figures d'arts martiaux particulièrement évoluées et transmises depuis des millénaires, Pickle surprend tout le monde.
Au cœur de Tokyo, Pickle se mesure au légendaire combattant de rue Kaoru Hanayama, un humain actuel doté des pouvoirs d'un dinosaure du Jurassique.
Katsumi Orochi n'a jamais été capable de se faire respecter par ses pairs… mais le moment est peut-être enfin venu pour lui de passer à la catégorie supérieure.
Quand Pickle l'identifie comme une proie, Katsumi, galvanisé, déclenche rapidement son nouveau coup de poing fétiche et tant travaillé.
Sous les yeux fascinés du public, Katsumi Orochi sacrifie tout à ses attaques supersoniques, ce qui n'empêche pourtant pas Pickle de se relever.
Dans un duel entre passé et présent, le naturellement fort Pickle affronte un homme qui a ingéré les substances les plus sophistiquées pour améliorer ses performances.
Après être entré dans l'enclos de Pickle, Baki commence par s'y adapter en respirant le même air, mangeant la même nourriture et vivant comme l'homme préhistorique.
Les effets de sa chute de plus de neuf mètres continuent de broyer Baki. Tant et si bien que même Pickle semble perturbé à la vue de son adversaire.
Baki passe à l'offensive en visualisant simultanément trois dinosaures différents tout en tabassant Pickle, qui répond alors par un mouvement vraiment inattendu.
Conscient que l'homme qu'il affronte aujourd'hui surpasse tous les adversaires qu'il a jamais croisés, Pickle prend sa forme véritable et toute-puissante.
La vie de Baki reprend un cours normal, mais pas pour longtemps. Après avoir croisé un ancien collègue de sa mère, Baki repense à la relation tumultueuse de ses parents.
Strydum se prépare à affronter Yujiro Hanma. Mitsunari Tokugawa avertit par la suite le Premier ministre du combat à venir entre Yujiro et Baki.
Même s'il s'entraîne à la boxe, Retsu n'a aucune intention de changer son style kenpō. Le champion de boxe Akio Mani le défie lors d'un combat d'entraînement.
À peine débarqué au Japon, le légendaire promoteur de boxe Kaiser pénètre dans le gymnase où Retsu s'entraîne. Impressionné, il lui fait une proposition.
On annonce le premier match de boxe de Retsu aux États-Unis, contre l'ancien champion du monde Andrei Valev. Pendant ce temps, Baki a une prémonition.
Pour une raison inconnue, Chiharu Shiba persiste à vouloir se battre avec Baki. Pendant ce temps, Retsu se prépare à affronter Smoking Joe, un boxeur aguerri.
Malgré les raclées, Chiharu Shiba n'abandonne jamais et son obstination fascine Baki qui veut s'en inspirer. Étourdi, Retsu vacille sous une avalanche de coups.
Baki prépare à manger et met la table ; son père arrive et s'assied. Mais il ne s'agit pas d'un repas de famille ordinaire.
Leur bon repas dans un hôtel de luxe dégénère lorsque Baki pose une question intime à Yujiro, provoquant une altercation historique.
Baki riposte aux attaques de son père grâce à une visualisation originale. Pendant ce temps, la nouvelle de ce combat épique se propage et une foule immense se rassemble.
Sous les yeux d'une assistance de plus en plus dense, le combat père-fils se poursuit. Baki lance une offensive contre son père avec une attaque de tricératops.
En utilisant une ancienne technique de combat, Baki pense avoir enfin réussi à maîtriser définitivement Yujiro. Mais il remarque alors la main de son père.
Employant un mouvement secret extrêmement efficace, Yujiro saisit Baki et le fait tourner autour de lui à une telle vitesse que son fils commence à perdre connaissance.
Leur duel a dépassé toutes les attentes. Et la rivalité familiale opposant l'être le plus puissant du monde à son fils arrive enfin à son terme…