Maintenant qu'il vit à travers le monde virtuel répétitif de SE.RA.PH., la fureur envahit progressivement Hakuno, nourrissant ainsi en lui une détermination implacable.
Saber se présente avec aplomb, et familiarise Hakuno aux combats qui l'attendent. Mais trouver un autre Master pour se battre se montre plus difficile que prévu...
Hakuno et Saber nouent des liens avec Rin, une résistante autoproclamée. Hakuno apprend qu'il doit tuer Shinji, le boss du niveau, afin de passer au stade suivant.
Immédiatement après avoir atteint le niveau supérieur, Hakuno et Saber tombent dans une embuscade. La situation semble désespérée, mais Rani VIII, un inconnu, intervient.
Rani VIII raconte à Hakuno l'histoire de Dan Blackmore, le boss du niveau, qui ne peut jamais progresser, indépendamment du nombre de vies qu'il prend.
Après avoir atteint le mystérieux troisième niveau, Hakuno fait la connaissance d'Alice, une cyber fantôme qui vit seule dans ce pays des merveilles hanté.
Il n'y a qu'un moyen de sortir de la boucle temporelle dans laquelle ils sont pris : vaincre Alice. Pourtant Hakuno hésite, même s'il sait qu'elle est une vraie tueuse.
Rin les prépare pour le cinquième niveau, où vagabonde un Berserker. Pas de boss ici, mais le danger n'en est pas moins grand, bien au contraire.
Une fille d'apparence familière du nom de Hakuno Kishinami apparaît. Saber annonce à la version masculine d'Hakuno qu'elle ira affronter le Berserker une fois encore.
Maintenant au sixième niveau, Hakuno et Saber sont soudain attaqués par une horde d'êtres qui ressemblent à s'y méprendre à Rin et Rani !
Hakuno et Saber atteignent le dernier niveau. C'est là que, mille ans auparavant, une incarnation précédente du jeune homme a vaincu le Master avant de périr.
Maintenant qu'ils sont revenus à la strate la plus basse, il semblerait que Hakuno et Saber n'aient plus qu'à tout recommencer, mais contre la montre.
L'heure de l'ultime bataille a sonné. Twice Pieceman, le dernier adversaire d'Hakuno, révèle son identité, et les raisons de l'élaboration de cette guerre.