Lukas et son père prennent soin de Kong alors que le petit singe grandit et devient un puissant gorille, mais quelqu'un veut à tout prix éliminer leur protégé.
Lukas, Kong et ses amis volent au secours de la nièce d'Anita attaquée par un anaconda géant. Richard s'emploie à transformer le serpent en machine de guerre high-tech.
Lorsque la TV diffuse des images de Kong dérobant des diamants, Lukas sait qu'il s'agit d'un coup monté. Pourra-t-il faire triompher la vérité et innocenter son ami ?
En mission pour libérer des clones ligres du laboratoire de Richard, Jonesy découvre un moyen de rendre Kong invisible. Hélas, le camouflage ne tient pas assez longtemps.
Richard capture l'un des membres du groupe et tend un piège aux autres. Kong doit affronter sa plus grande peur s'il veut sauver Lukas de redoutables requins-robots.
Richard joue les héros pour mener à bien un de ses plans diaboliques. Danny et Panchi se faufilent incognito sur l'île pour découvrir ce qu'il mijote.
Alors que Kong et le groupe tentent d'échapper à la police, ils tombent sur la dernière invention de Richard : un robot dinosaure animé par l'esprit de Botila.
Tandis que les armées du monde entier s'arrachent les bionobots de Richard, Jonesy tente de pirater le système de Botila pour découvrir leurs véritables intentions.
Kong, touché par un rayon rétrécisseur, est à la merci de Richard et de Botila. Mais cette fois, sa super-force ne lui est d'aucune utilité.
Il reste peu de temps à l'équipe pour désamorcer une nouvelle menace en Arctique. Kong apprend à combattre sur la glace tandis que Botila montre des signes de rébellion.
Botila prend l'avantage sur Richard et développe une fâcheuse habitude. Lukas et ses amis se demandent s'ils doivent accepter une demande pour le moins surprenante.
Richard s'apprête à lancer une armée d'insectes tueurs. Kong se pose des questions sur ses propres origines à l'occasion de l'anniversaire de Panchi.
Jonesy et Amy livrent l'antidote. De leur côté, Lukas et les enfants cherchent Kong. Richard attire le groupe au bord d'un volcan et leur prépare une surprise de taille.
Tombés dans un volcan, Kong et compagnie se retrouvent dans un monde souterrain peuplé de véritables dinosaures ! Sur l'île Kong, Botila fomente une révolution.
La bande brave des geysers, manque de se faire piétiner et affronte divers désagréments pour arriver au temple où ils découvrent de nouveaux indices sur le passé de Kong.
À l'autre bout du tunnel, l'équipe trouve des créatures géantes qui ravagent l'Égypte. Richard découvre qu'il est recherché.
À nouveau considéré comme un héros, Kong profite des projecteurs lors d'une cérémonie à New York. Mais quand Botila arrive, la fête se transforme en affrontement.
Cherchant un nouveau quartier général, l'équipe se rend sur l'île Kong qu'elle découvre envahie de singes espiègles et autres bionobots.
De retour au temple, Danny et Zippi explorent un tunnel secret, tandis que les autres subissent un effondrement. Botila rencontre un ordinateur de vaisseau digne d'elle.
Lukas participe au sauvetage d'un bébé dinosaure échoué. Les singes révèlent ce que la clé de Danny peut faire. Botila utilise ses nouveaux pouvoirs dans l'espace.
Quand Botila menace de faire sauter la Terre, Kong et ses amis partent en mission pour désarmer le satellite... sauf que Jonesy n'est pas sur le bon vaisseau.
N'en pouvant plus de Botila, les clones et les bionobots organisent une rébellion. Parti à la poursuite de Zippi, Kong est capturé par un mystérieux personnage.
Suivant le signal de Kong jusqu'à l'île Kong, Lukas et sa bande affrontent un ennemi colossal et reçoivent une aide tout à fait surprenante.