Les ninjas sont subitement ramenés à la réalité quand Lloyd, le fils de Lord Garmadon, fait son entrée et tente de reprendre le flambeau de son père.
Alors que Lloyd et les Hypnobrai menacent, Zane se lance à la poursuite d'un faucon et s'attire un tas d'ennuis.
Lloyd libère les Fangpyres pour l'aider à reprendre le contrôle. Les ninjas passent à l'action quand les Fangpyres attaquent le village de la famille de Jay.
Les Fangpyres s'allient aux Hypnobrai, et Lloyd réveille Pythor, le dernier serpent de la tribu des Anacondrai.
Lloyd cherche désespérément à se rendre utile, tandis que Pythor réveille plusieurs tribus, faisant éclater une guerre des serpents.
Pythor décide de réveiller le Grand Dévoreur, un monstre légendaire et invincible capable d'anéantir Ninjago.
Les quatre ninjas suivent le mystérieux faucon dans les bois et tombent sur un atelier caché où Zane en apprend plus sur son passé.
Jay et Nya abrègent leur premier rendez-vous au parc d'attractions quand ils apprennent que les Serpentines sont en route pour récupérer l'une des quatre lames sacrées.
Les ninjas se font passer pour une troupe de danse et participent à un concours de talents pour remporter la coupe où se cache l'une des lames.
Quand Lord Garmadon se met à la recherche de son fils, les ninjas deviennent méfiants et réalisent qu'ils vont devoir collaborer.
Les ninjas tombent dans un piège en tentant d'infiltrer le sanctuaire des Serpentines et Lloyd ne parvient pas à les sauver. Seul Lord Garmadon pourra leur venir en aide.
Les ninjas se lancent dans une véritable course contre la montre pour atteindre la cité perdue d'Ouroboros et empêcher Pythor de réveiller le Grand Dévoreur.
La catastrophe menace alors que les ninjas doivent vaincre le Grand Dévoreur dans une tentative désespérée pour sauver Ninjago.
Après le début de la reconstruction de Ninjago, les quatre ninjas réalisent que Lord Garmadon a transformé les armes d'or en une arme suprême.
Les ninjas doivent empêcher le terrible Capitaine Soto et ses pirates de piller Ninjago City après qu'ils ont été accidentellement ressuscités par Garmadon.
Nos héros retournent à Darkly et découvrent qu'ils ont été piégés par Lord Garmadon et ses diaboliques clones ninjas.
En apprenant que le Grand Dojo de Dareth a été détruit, les ninjas participent à la course Ninjaball annuelle pour tenter de décrocher le gros lot et sauver le dojo.
Voulant empêcher Garmadon d'utiliser son arme suprême pour ressusciter un monstre fossilisé, les ninjas se retrouvent transformés en enfants.
Garmadon remonte le temps pour débarrasser le futur des ninjas, mais ces derniers le suivent et tentent de l'arrêter en utilisant les armes d'or.
Les ninjas affrontent un guerrier de pierre que le venin toxique du Grand Dévoreur a ramené à la vie.
Les ninjas tentent d'échapper à l'armée de pierre ressuscitée par le venin toxique du Grand Dévoreur, tandis que Garmadon veut prendre le contrôle de l'armée.
Les ninjas, Lloyd, Sensei Wu et Misako se rendent sur l'île des Ténèbres pour trouver le Temple de la Lumière et rendre leurs pouvoirs élémentaires aux ninjas.
Après avoir vaincu l'armée de pierre, les ninjas arrivent au Temple de la Lumière où ils font usage de leurs pouvoirs contre Lloyd.
Les ninjas tentent de rapporter le casque de Garmadon pour empêcher l'affrontement final entre Lloyd et son père.
Garmadon utilise sa nouvelle arme redoutable sur le village de Jamanakai, laissant ainsi l'esprit de l'Overlord posséder son corps.
La force obscure de l'arme suprême de Garmadon s'est abattue sur Ninjago, mais les ninjas découvriront bientôt que le bien finira par l'emporter.
Après la défaite d'Overlord, Ninjago City reprend vie et les Ninjas enseignent à l'académie de Sensei Wu. Mais la paix ne dure qu'un temps.
Après avoir été poursuivis jusqu'au monastère de Sensei Garmadon par les Nindroïdes, les Ninjas retournent subrepticement à Ninjago City.
Zane abandonne la moitié de ses pouvoirs pour sauver P.I.X.A.L., mais les ennemis se mettent à attaquer de toutes parts. Lloyd et son père vont au labyrinthe d'Hiroshi.
Les Ninjas descendent dans les profondeurs de Ninjago City. Ils découvrent des secrets sur la tribu Serpentine alors qu'ils combattent à ses côtés contre les Nindroïdes.
Les ninjas s'aventurent dans le Digiverse pour affronter l'Overlord numérique. Pendant ce temps, Pythor et Wu mènent une attaque nindroïde sur la tour Borg.
Pendant que Pythor et les Nindroïdes libèrent l'Overlord numérique, Wu et Garmadon découvrent le plan ultra secret de Pythor appelé Projet Arcturus.
Après avoir repoussé les Nindroïdes hors de l'Arcturus, les ninjas redoublent d'efforts alors que la bataille se poursuit au cœur d'une comète.
Les Nindroïdes utilisent les armes d'or pour transformer l'Overlord en Maître d'or, tandis que, dans les ruines de Ninjago, les ninjas préparent leur ultime bataille.
Après avoir découvert que Zane est peut-être en vie, les ninjas apprennent qu'ils doivent participer au Tournoi des éléments pour avoir une chance de le revoir.
L'équipe découvre les lames de jade et d'autres secrets du Tournoi des éléments. Karlof est éliminé de la compétition.
Le tournoi commence. Cole est bientôt forcé de se battre contre Jay, et Zane recouvre la mémoire grâce à P.I.X.A.L.
Les maîtres élémentaires restants s'affrontent aux patins à roulettes. Cole, Karlof et d'autres éliminés sont contraints de travailler dans l'usine de nouilles de Chen.
Après avoir révélé le plan de Chen, les ninjas concluent une alliance avec les maîtres élémentaires. Cole et Zane s'évadent de l'usine de nouilles.
Lloyd et Garmadon apprennent qu'une grande bataille a jadis eu lieu entre Chen, les Anacondra et les maîtres élémentaires pour le contrôle de Ninjago.
Tout semble perdu lorsque Chen vole les pouvoirs des maîtres élémentaires et ressort vainqueur d'un combat contre Lloyd.
Chen et son armée envahissent Ninjago City, mais les maîtres se sont évadés de l'usine de nouilles et les suivent de près. Garmadon échappe de peu au bannissement.
Maître Chen utilise un sort pour se transformer, ainsi que ses troupes, en terribles Anacondra. Mais les ninjas recrutent un allié inattendu à la prison de Ninjago City.
L'affrontement final entre les ninjas et les Anacondra a lieu, mais un grand sacrifice est nécessaire pour assurer la victoire.
Possédé par Morro, Lloyd infiltre le salon de thé et attaque les autres ninjas qui ont mystérieusement perdu leurs pouvoirs.
Après avoir découvert un indice menant à la tombe du premier maître du Spinjitzu, les ninjas se rendent à Stiix pour récupérer les parchemins du Airjitzu volés.
Wu entraîne Nya à maîtriser ses nouveaux pouvoirs d'eau. Les ninjas élaborent un plan pour dérober les parchemins du Airjitzu mais ils doivent d'abord affronter Morro.
Les ninjas se rendent au temple hanté de Sensei Yang pour y apprendre le Airjitzu. Nya arrête l'entraînement mais doit utiliser ses pouvoirs face aux fantômes de Morro.
Dotés de l'Airjitzu, les ninjas se lancent dans l'ascension d'une montagne périlleuse afin de trouver le sabre du sanctuaire avant Morro.
Après avoir été trahis au royaume des nuages, les ninjas affrontent Morro afin de récupérer le sabre du sanctuaire. Ils apprennent qu'il recherche le cristal du royaume.
Les ninjas sont sur le point de trouver l'emplacement de la tombe du premier maître du Spinjitzu, mais Ronin vole le sabre du sanctuaire pour le donner à Morro.
Le chemin menant à la tombe du premier maître du Spinjitzu est semé d'embûches. Pour y parvenir, les ninjas doivent déjouer ses pièges et affronter Morro.
Les ninjas tentent d'empêcher Morro de libérer la Très puissante, mais Morro se sert du cristal du royaume pour invoquer une armée de fantômes issus du royaume maudit.
Les ninjas essaient de protéger Stiix, Lloyd rencontre son père au royaume maudit, et Nya libère son véritable potentiel pour venir à bout de la Très puissante.
Le statut des ninjas passe rapidement de héros vénérés à gibiers de potence quand quelqu'un qui les imite commet des crimes à travers Ninjago City.
Alors que Nadakhan complote afin de récupérer le Cristal du royaume, les ninjas en cavale sont poursuivis par Ronin, embauché par la police pour les traquer.
Emprisonnés à tort, les ninjas rencontrent un captif qui connaît un venin rare susceptible d'arrêter Nadakhan, mais ce poison n'existe que sur une seule île.
Nadakhan convainc Jay de faire un vœu concernant Nya, mais Flintlocke détruit accidentellement le Cristal du royaume, et Cole s'empare de la carte de Soto.
Tandis que des zones entières de Ninjago City disparaissent, les ninjas se dirigent vers l’île où Jay doit recueillir le précieux venin, mais Nadakhan est à ses trousses.
Pris au piège sur l’île, Lloyd, Cole et Nya tentent de s'échapper sur un radeau, tandis que les compagnons d'équipage de Nadakhan forcent Jay, captif, à les combattre.
Après s’être entraînés à parler comme des pirates, les ninjas infiltrent le navire de Nadakhan afin de lui faire absorber le venin et sauver Jay de la captivité.
Persuadé que Nadakhan abandonnera son équipage dès que tous ses souhaits pourront être exaucés, Flintlocke mène une mutinerie, mais le djinn l'emporte et capture Nya.
Tandis qu'au temple djinn, Nya est obligée de répéter pour son mariage avec Nadakhan, Jay recrute une nouvelle équipe qui part en mission afin de sauver ses amis.
En épousant Nya, Nadakhan obtient le pouvoir de souhaits infinis, mais Flintlocke et Dogshank s'allient aux ninjas pour affronter le djinn lors d'un combat final épique.
Lorsque Maître Wu reprend seul un combat commencé il y a longtemps contre Acronix, l'un des jumeaux Mains du temps, les ninjas tentent de lui venir en aide.
Les ninjas en apprennent davantage sur les Maîtres élémentaires Krux et Acronix, puis découvrent qu'ils ont un nouvel ennemi.
Kai utilise un casque de Guerrier Vermillion pour en savoir plus sur Krux, Lloyd a du mal à se faire à son rôle de maître en devenir, et Nya essaie de redémarrer Zane.
Alors que les Guerriers Vermillion commettent plusieurs vols mystérieux, Lloyd découvre qu'il n'est pas facile de se montrer à la hauteur de Maître Wu.
Les ninjas se battent pour sauver un parc d'attractions, et Jay défend sa maison face aux Guerriers Vermillion... jusqu'à l'arrivée de la Lame du temps émeraude.
Toute l'équipe célèbre sa victoire et se réjouit d'avoir retrouvé la Lame du temps émeraude, mais la fête est de courte durée.
Alors que le reste des ninjas tente de trouver Maître Wu pour le sauver, Nya affronte celui qui se fait passer pour le Samouraï X. Kai cherche la vérité sur ses parents.
Kai découvre que ses parents ont tous les deux été faits prisonniers. Pendant ce temps, une troisième Lame du temps apparaît.
Les Mains du temps obligent Kai et Nya à utiliser leurs pouvoirs élémentaires pour tirer la quatrième Lame du temps de la mer Bouillonnante.
Kai et Nya voyagent dans le passé pour aider les Maîtres élémentaires à empêcher les Mains du temps de changer l'histoire de Ninjago.
Lorsque le Masque de la Tromperie tombe entre les mains d'un nouveau méchant, Lloyd décide de rassembler les ninjas.
Une explosion causée par les Fils de Garmadon entraîne la disparition d'une autre relique, et des parents de la princesse Harumi avec laquelle Lloyd s'est lié d'amitié.
À la recherche du gang des Fils de Garmadon, les ninjas interrogent le membre qu'ils ont capturé, puis infiltrent un club de karaoké.
Zane est emmené à la base secrète des Fils de Garmadon, où il en apprend plus sur leur mystérieux chef. Pendant ce temps, Lloyd découvre la véritable mission du gang.
Zane et Mr. E s'affrontent au cours d'un combat épique alors que le vaisseau des ninjas se lance dans une mission périlleuse à la recherche du troisième masque Oni.
Séparés après un terrible accident, les ninjas tentent de récupérer le masque Oni avant les Fils de Garmadon.
Un flashback révèle la vérité sur l'identité du Silencieux alors que Lloyd et Harumi s'aventurent encore plus loin dans le temple Oni, à la recherche du troisième masque.
À son réveil, Lloyd découvre qu'il a été fait prisonnier par le Silencieux, qui a prévu de ressusciter Lord Garmadon avec un autre otage.
Les ninjas célèbrent leur victoire chez Laughy... jusqu'à ce qu'ils apprennent que Garmadon a aidé Harumi à s'évader.
Mistaké soigne les blessures de Lloyd, mais sa survie a un prix. Garmadon fait appel à un géant destructeur pour montrer toute l'étendue de ses pouvoirs.
Lloyd se cache des forces d'occupation de l'empereur Garmadon et Harumi. Le jeune Wu et les ninjas sont coincés dans le royaume des Oni et des dragons.
Iron Baron condamne Jay, Kai et Zane à se battre contre un dragon dans une arène. À Ninjago, Lloyd rassemble un groupe de résistants.
Les ninjas sont mis en cage afin de servir d'appât pour un dragon. Lloyd et son équipe cherchent à accéder à une station émettrice pour diffuser un message d'espoir.
Réduits en esclavage, les ninjas rassemblent du matériel pour que Cole et Wu construisent un faux dragon. Les Fils de Garmadon attaquent les rebelles de Lloyd.
Lloyd et quelques résistants sont sur le point de se faire capturer dans le véhicule de Nya. Dans le royaume des Oni et des dragons, les ninjas et Wu prennent la fuite.
Mistaké révèle sa vraie nature et son passé, tandis que Wu mène les recherches pour retrouver Firstbourne.
L'identité de Wu est révélée alors que Lloyd et ses camarades élaborent un nouveau plan impliquant Harumi.
Capturé, Wu retrouve soudainement la mémoire alors qu'il subit des électrochocs. Lloyd se sert de pouvoirs volés pour tenter de prendre le contrôle du titan des Oni.
En colère, Garmadon cherche à reprendre le contrôle pendant que Wu et Iron Baron se rendent dans le nid de Firstbourne.
Les ninjas reviennent à Ninjago qui subit une terrible attaque. Maître Wu et Lloyd affrontent Lord Garmadon.
Confiance arrive avec de mauvaises nouvelles, forçant Lloyd à envisager une alliance avec Lord Garmadon.
Malgré leurs doutes, les ninjas libèrent Lord Garmadon afin qu'il puisse entrer dans le nuage de ténèbres avec Lloyd.
L'équipe paie le prix fort lorsqu'elle essaie de sauver Lloyd et Lord Garmadon qui découvre le point faible des Oni en se battant contre l'Oméga.
Les ninjas retournent rapidement au monastère du Spinjitzu, où ils doivent combiner leurs pouvoirs lors d'un affrontement final contre les Oni.