Alors que l'équipe panse ses plaies après l'attentat à la bombe, elle doit retrouver le responsable et mettre en œuvre une solution radicale.
Tandis que le corps d'une employée du NCIS fait surface quatre mois après un attentat à la bombe, chaque membre de l'équipe doit subir une évaluation psychologique.
En revenant sur une affaire datant de plusieurs années, Ducky découvre qu'il existe un lien avec l'enquête que mène actuellement l'équipe sur la mort d'un Marine.
L'équipage d'un hélicoptère qui s'est écrasé en pleine mer est retrouvé sur la côte quelques jours plus tard. L'équipe du NCIS est chargée d'enquêter sur l'accident.
En enquêtant sur le meurtre d'un officier de marine, l'équipe découvre un lien avec le lauréat d'une médaille d'honneur qui était aussi un ami proche du père de Gibbs.
Alors qu'il enquête sur la mort brutale d'un officier, Gibbs découvre que le témoin principal souffre d'un trouble de stress post-traumatique.
Gibbs continue à aider un marine souffrant d'un trouble de stress post-traumatique pendant que l'équipe s'efforce d'empêcher un terroriste de nuire.
Tandis que Gibbs demande à une vieille connaissance de l'aider à retrouver une ado kidnappée, Abby et Ziva s'occupent de l'amie de celle-ci, seule témoin de l'enlèvement.
Gibbs et l'agent du FBI T.C. Fornell traquent un tueur qui a tenté d'éliminer ce dernier… en composant avec Diane Sterling, leur ex-femme à tous les deux.
L'esprit de Noël est mis à mal quand les membres du NCIS entament une enquête pour meurtre qui les mène à un mystérieux magot.
Alors que l'équipe enquête sur un meurtre impliquant un second maître et un journaliste, le directeur du Mossad et père de Ziva rend une visite surprise à sa fille.
Tandis que Ziva enterre son père, l'équipe traque l'homme de main – auteur du massacre chez les Vance – et son commanditaire.
Alors que l'équipe du NCIS enquête sur un accident de voiture mortel impliquant un marine, de pénibles souvenirs d'enfance reviennent hanter Abby.
Gibbs et son équipe appréhendent un cyberterroriste célèbre et s'aperçoivent bien vite que ses plans sont plus ambitieux qu'ils l'imaginaient.
Alors que l'équipe enquête sur la mort soudaine d'un Marine, des indices l'orientent vers un club de combats illégaux. En parallèle, Vance reçoit de choquantes nouvelles.
Ducky et Palmer se font enlever alors qu'ils ramènent le corps d'un officier qui s'est suicidé au quartier général du NCIS.
Tandis que le coiffeur de Gibbs pense que son fils est impliqué dans un meurtre, l'équipe du NCIS soupçonne un Marine d'avoir volé une petite fortune à la Navy.
La femme d'un maître-chien de la Marine a des doutes sur les circonstances de sa mort. Elle demande à Gibbs et son équipe d'enquêter.
Lorsqu'un médecin est tué à bord d'un navire de la Navy en pleine tempête, le père de McGee, avec lequel il ne s'entend pas, figure sur la liste des nombreux suspects.
Tandis que l'équipe enquête sur la disparition du mari d'une réserviste de la Navy, Tony craint que Ziva cherche à venger la mort de son père.
Le NCIS se penche sur un agent du Mossad qui sème le trouble en Virginie. Tony et Ziva se rendent à Berlin pour retrouver le meurtrier du père de celle-ci.
Bien qu'elle ait reçu l'ordre de rester en dehors de l'affaire, l'équipe intensifie ses recherches pour retrouver Bodnar – et Ziva venge la mort de son père.
Le NCIS se retrouve dans le collimateur du département de la Défense au sujet de sa gestion de l'affaire Bodnar… et Gibbs est en première ligne.
Alors que le reste de l'équipe enquête sur la mort d'un SEAL, Gibbs fait l'objet d'une surveillance accrue de la part du département de la Défense dans l'affaire Bodnar.
Une explosion ayant fait une victime liée à l'agence change le regard que Parsons porte sur Gibbs et l'équipe. DiNozzo et McGee enquêtent en civil.
Bien décidé à retrouver Ziva, Tony suit des pistes en Israël. Gibbs et l'équipe traquent sans relâche Parsa et son réseau terroriste grandissant.
L'équipe doit se fier à Twitter dans son enquête sur la disparition d'un lieutenant de marine. McGee perd son badge sans en avertir ni Gibbs ni les autorités.
Gibbs et McGee se rendent en Afghanistan quand un meurtre les mène jusqu'à un refuge pour femmes afghanes que Mike Franks soutient en secret depuis des années.
DiNozzo renoue avec son passé au sein de la police de Baltimore quand il aperçoit un homme suspecté dans une vieille affaire, sur la scène du meurtre d'un premier maître.
Tandis que le NCIS collabore avec les enquêteurs des garde-côtes pour identifier les raisons de l'explosion d'une plateforme pétrolière, un farceur s'en prend à l'équipe.
Gibbs étant parti au beau milieu d'une enquête pour aider son père à renouer avec un ancien pilote de guerre, Tony et McGee se disputent la direction de l'équipe.
Quand une avocate, ex-agente du FBI, se confie à Gibbs, l'équipe réexamine une affaire de meurtre avec délit de fuite. McGee s'inquiète du comportement étrange de Tony.
Après la découverte de la mise sur écoute de la SECNAV lors d'une réunion confidentielle, l'analyste de la NSA qui avait prédit cette faille de sécurité rejoint l'équipe.
L'équipe découvre un lien entre une victime de meurtre et le petit ami de Diane Sterling, l'ex de Gibbs et de Fornell. La nouvelle analyste prend ses marques au NCIS.
Quand une mystérieuse maladie frappe des enfants de militaires, l'équipe enquête et aide les médecins chercheurs. Vance a du mal à accorder son pardon.
Quand un drone volé mène à un terroriste insaisissable, le NCIS fait équipe avec le département de la Défense, dont fait partie l'ex de Gibbs.
À la poursuite d'un terroriste, l'équipe trouve l'un de ses comparses grâce à des indices retrouvés lors de l'attaque de drone. Très éprouvé, McGee subit le contrecoup.
Le meurtre d'un officier de la sécurité portuaire expose l'endroit où se trouve peut-être Parsa. Bishop révèle son implication dans le dossier du terroriste introuvable.
Ayant trouvé des gilets pare-balles défectueux parmi d'autres équipements réservés aux marines, l'équipe cherche le responsable et les gilets déjà livrés aux soldats.
Après avoir abattu un homme se faisant passer pour un officier, DiNozzo fait l'objet d'une enquête. Son père, venu lui révéler un secret, est le seul témoin de la scène.
Lorsqu'une bombe explose avant un concert militaire de bienfaisance, l'équipe cherche à savoir si la cible était un rockeur ou si une machination plus vaste se trame.
Quand le corps d'un politicien, ex-agent du NCIS, s'échoue à La Nouvelle-Orléans, les deux agences concernées font équipe pour démêler le motif et retrouver l'assassin.
Ayant trouvé des indices, Gibbs et l'agent spécial Pride sont sur la piste d'un imitateur de tueur en série à La Nouvelle-Orléans. Bishop envoie un souvenir à DiNozzo.
De retour au département de la Défense, la petite amie de McGee trouve une faille dans une affaire controversée. DiNozzo conseille McGee en amour.
L'équipe cherche à savoir si un officier a été tué lors d'une bagarre dans un bar ou parce qu'il en savait trop. DiNozzo et McGee font une cure détox.
L'équipe enquête sur la disparition d'un photographe qui devait témoigner lors d'une audience dans le cadre d'un procès en cour martiale.
DiNozzo a pour mission de ramener de France la fille d'un amiral, mais il doit demander de l'aide à l'équipe quand il tombe sur une scène de crime qui pose problème.
Le NCIS enquête sur un incendie survenu à bord d'un navire qui servait de prison secrète pour terroristes. Gibbs rentre dans sa ville natale à la mort de son père.
Quand la mission à l'étranger de Gibbs et McGee est compromise, l'équipe du NCIS tente de les localiser avant un groupe de mercenaires russes.
L'équipe du NCIS doit déterminer si un meurtre récent à Washington est lié à une agression ou à une réunion privée avec le président.
Ducky retourne à Londres lorsqu'une affaire du NCIS s'avère liée à l'un de ses anciens amis d'enfance.
L'équipe du NCIS doit collaborer au sein d'une unité spéciale anti-terroriste après le meurtre d'une brillante chercheuse de la Navy.
Le NCIS enquête sur un homme tombé par-dessus bord et découvre que Gibbs est prisonnier d'un bateau pris d'assaut par des pirates.
L'équipe du NCIS enquête sur le meurtre de la femme d'un commandant de la Navy qui a récemment figuré parmi les cibles des djihadistes.
Gibbs prend à cœur de résoudre une affaire liée à une organisation caritative frauduleuse qui vise les familles et les amis de militaires disparus.
Gibbs essaie d'aider une aide-soignante de la Navy arrêtée pour exercice illégal de la médecine après avoir prodigué des soins aux victimes d'un accident de la route.
Bishop et son mari enquêtent avec DiNozzo sur une menace terroriste dans un aéroport plein de voyageurs la veille de Thanksgiving.
L'équipe du NCIS se renseigne auprès de trois détenus cyberterroristes lorsqu'une coupure générale d'Internet a lieu à Washington une semaine avant Noël.
Alors que les deux ex-femmes de Gibbs se disputent son attention, l'équipe examine des scènes de crime qui rappellent d'autres meurtres similaires.
L'équipe du NCIS recherche un terroriste américain impliqué dans l'enlèvement d'une femme travaillant pour une organisation humanitaire en Syrie.
Lorsqu'un officier est assassiné avant de devenir le premier militaire ouvertement gay à recevoir la médaille d'honneur, le NCIS enquête sur un possible crime de haine.
L'équipe du NCIS essaie de faire la lumière sur le meurtre d'un Marine qui est allé à la même école militaire que DiNozzo.
Alors que son pire ennemi est le principal suspect d'une enquête, Gibbs décide de laisser l'équipe s'en occuper afin d'aider Fornell à surmonter un deuil.
Une affaire d'homicide est transférée au NCIS quand l'identité retrouvée sur la victime correspond à celle donnée à Gibbs vingt ans auparavant.
Dans le cadre d'une affaire de meurtre, l'équipe du NCIS fait appel aux connaissances et aux contacts du père de DiNozzo sur le marché noir de l'art.
Une enquête est menée avec Delilah et le département de la Défense lorsqu'un indice lié à une cellule terroriste à Dubaï est retrouvé dans le cadre d'une affaire de meurtre.
Le NCIS établit un lien entre le meurtre d'un sous-officier de la marine et une affaire non résolue datant de 40 ans : un attentat à la bombe dans un aéroport américain.
DiNozzo fait équipe avec sa petite amie, l'agente Zoe Keates, lorsque des preuves amènent le NCIS et l'ATF à collaborer sur une enquête.
Gibbs et Bishop partent à l'étranger quand l'équipe du NCIS établit un lien entre la mort d'un Marine et un groupe terroriste en Afghanistan.
La division des cyberopérations du NCIS envoie l'agent spécial Ned Dorneget aider l'enquête sur le meurtre d'une ingénieure en guerre cybernétique de la Navy.
L'affaire avec la division cybernétique se poursuit : l'équipe découvre qu'un groupe pousse des jeunes à perpétrer des actes de terrorisme à l'échelle mondiale.
Après un attentat meurtrier à l'étranger, le NCIS collabore avec plusieurs agences pour retrouver un groupe terroriste international qui recrute des ados sur Internet.
Tandis que Gibbs se rétablit sur un navire, Tony et l'agent de la CIA Joanna Teague unissent leurs forces à Shanghai pour démanteler une cellule terroriste.
Gibbs revient au NCIS avec un nouveau look qui intrigue l'équipe. Sa première affaire l'associe à un agent de la DEA avec lequel il a un passé commun.
Un Marine est assassiné à Quantico après avoir contacté Gibbs au sujet d'une affaire. McGee et Bishop jouent les couples mariés afin de surveiller un suspect et sa femme.
Le directeur Vance retourne sur le terrain avec Gibbs pour enquêter sur un meurtre qui les ramène à une ancienne enquête de Vance impliquant un agent du NCIS.
Abby se retrouve prise au piège dans un laboratoire pharmaceutique attaqué par des hommes armés qui prennent les employés en otage.
Tandis que McGee et Delilah franchissent un nouveau cap dans leur relation, l'équipe enquête sur une série de meurtres qui pourraient être l'œuvre d'un imitateur.
L'équipe aide le club de Ducky à déterminer si le fils d'un ex-officier de la Navy récemment assassiné a été condamné à tort pour meurtre plusieurs années auparavant.
Tony et McGee recherchent au Soudan du Sud des médecins bénévoles qui ont disparu, dont le mari de l'ex-petite amie de Tony. La santé de Gibbs lui joue des tours.
Un quartier-maître accusé d'avoir tué son ex demande au NCIS de trouver le véritable assassin. Bishop fait une troublante découverte.
Bishop rentre chez elle en Oklahoma pour Thanksgiving. Mais l'heure n'est pas à la fête, car l'équipe doit résoudre une affaire de contrefaçon, meurtre et leucémie.
À la suite d'une agression, Ducky explique qu'il recherche son demi-frère depuis plusieurs décennies. De retour au NCIS, Bishop prend une décision concernant son mariage.
Gibbs collabore avec le NCIS de la Nouvelle-Orléans pour retrouver le frère disparu d'Abby. [L'histoire se termine dans "NCIS: Nouvelle-Orléans", saison 2, épisode 12].
Lorsqu'un marin qui devait témoigner contre un réseau de trafiquants d'êtres humains est assassiné, le NCIS met tout en œuvre pour retrouver d'autres victimes.
Lorsqu'un homme meurt brusquement après avoir attaqué trois collègues dans une chambre de décompression, le NCIS doit résoudre l'affaire depuis l'extérieur de la chambre.
Lorsque la fille de la secrétaire à la Marine est enlevée et qu'une rançon est exigée, l'enquête de Gibbs et de l'équipe révèle une affaire plus complexe qu'il n'y paraît.
Le Dr Taft se joint à l'équipe du NCIS lorsque le suspect d'un vol d'armes meurt sur sa table d'opération. L'autopsie de Ducky lie le suspect à un ancien ennemi du NCIS.
Lorsqu'une affaire semble trop facile, les agents passent la soirée à revenir sur divers aspects du crime pour établir la vérité.
Gibbs se lie d'amitié avec un Marine, unique survivant d'une embuscade de snipers en Irak. Des preuves conduisent Abby à découvrir la mission du tireur sur le territoire.
La femme et la maîtresse d'un officier de la Navy assassiné affirment toutes deux avoir vu l'autre commettre le meurtre. Le père de Tony fait une étrange rencontre.
Tony découvre qu'il est victime d'usurpation d'identité après avoir reçu de l'argent liquide de la part d'un sénateur qu'un certain "Tony DiNozzo" fait chanter.
Gibbs et Fornell aident l'ancien directeur du NCIS Morrow à retrouver un ancien espion qui s'est évadé d'une prison britannique pour revenir clandestinement aux États-Unis.
Gibbs et Fornell recherchent un assassin. Quand le fils d'un Marine en mission tire sur un criminel à son domicile, Gibbs découvre que l'adolescent était la cible.
Fornell est gravement blessé. Gibbs, Monroe et l'agent du MI6 Reeves se concentrent sur Jacob. Abby établit un lien avec Kort. L'intuition de Gibbs le conduit à Ziva.
Le NCIS, le FBI et le MI6 poursuivent leur chasse à l'homme internationale pour retrouver l'espion britannique qui cible des agents.
L'explosion d'une voiture semble être liée à la disparition d'un agent du NCIS survenue quelques mois plus tôt lors d'une mission d'infiltration en Argentine.
Une bagarre pendant une réunion d'anciens lycéens aboutit à la mort accidentelle d'un homme et à la découverte de bombes dans son casier.
Le sergent des Marines Erin Hill est dans un état critique après une chute. Sa psychiatre demande à Gibbs d'enquêter comme s'il s'agissait d'une tentative de meurtre.
Gibbs, Quinn et Palmer conduisent des investigations sur la mort d'un lieutenant de la Navy sur un destroyer lors d'une croisière tigre où les civils sont autorisés à bord.
Quinn et Bishop sont envoyés à Philadelphie pour faire la lumière sur le lien entre un officier du MI6 disparu et un quartier-maître de la marine assassiné.
Après qu'un quartier-maître de la marine a échappé à son ravisseur, le NCIS commence à soupçonner l'implication de son mari disparu dans son enlèvement.
L'équipe du NCIS est aux prises avec un agent de l'Immigration américaine au sujet d'un homme sur le point d'être expulsé alors qu'il est témoin clé dans une affaire de meurtre.
Le NCIS enquête sur une série de menaces de plus en plus graves à l'encontre d'une membre du Congrès qui s'est fait des ennemis des deux bords politiques.
Bishop est envoyé à Guantanamo pour comprendre les dessous de la mort d'un chef de prière musulman qui s'occupait autrefois des détenus de la prison militaire.
Une enquête sur un délit de fuite est compliquée par la tentative de Palmer d'empêcher le fils de la victime de sauter du haut d'un immeuble.
Des preuves du meurtre d'un capitaine de la Navy qui faisait l'objet d'une investigation en interne semblent pointer vers l'adresse de la mère décédée de Ducky.
Après le capotage d'une opération visant à appréhender un homme d'affaires soupçonné de commettre des attentats pour manipuler la bourse, le NCIS cherche des pistes.
L'équipe du NCIS s'active pour retrouver Gibbs qui a pris l'initiative d'exhumer une ancienne enquête sous couverture.
Le meurtre d'un quartier-maître conduit à une collaboration entre le NCIS et les "Sherlock", une équipe d'investigation financée par des fonds privés.
Une fonctionnaire de l'Agence de défense logistique reçoit l'ordre de se suicider. Reeves et Bishop suivent de nouvelles pistes dans l'affaire Chen.
Abby est arrêtée après qu'une simulation d'attentat terroriste à laquelle elle participe pour un groupe de réflexion sur la sécurité intérieure a été compromise.
McGee trouve deux intrus dans son appartement. La députée Flemming tente de persuader le directeur Vance de se lancer dans une carrière politique.
Pour exaucer la dernière volonté d'un marin, l'équipe du NCIS se penche à nouveau sur une affaire dans laquelle il était initialement question d'une mort accidentelle.
Les agents du NCIS enquêtent sur la mort d'un Marine lors d'un événement organisé par un groupe qui organise des visites gratuites de monuments aux morts pour les vétérans.
L'équipe du NCIS est contrainte de rechercher le créateur d'un virus informatique qui a pris le contrôle des ordinateurs et des smartphones de l'agence.
L'assassinat d'un Marine pourrait être lié à un ancien gang de motards que Torres avait infiltré dans le cadre d'une enquête.
Le meurtre d'un sergent des Marines dans un parc national semble n'être que l'un des nombreux crimes commis dans la même région.
L'équipe du NCIS se rend à bord d'un destroyer où un jeune quartier-maître a été retrouvé sans vie. Delilah, la fiancée de McGee, est transportée d'urgence à l'hôpital.
Gibbs, McGee et Torres se rendent dans une zone dangereuse du Paraguay où des fragments de corps de plusieurs Navy SEALs disparus ont été repérés.